そのネットがどんな数字を集計しているかは書かれていないのでわかりませんが、国(総務省統計局)の調査などではもちろん手当や残業代、ボーナスなどをすべて含んでいます。 源泉徴収票に記載されている金額と考えてよいと思います。
サイトによって違う気がしますが、、例えば、以下などの年収は”支給額”という定義しかないので、人によっては残業もあったり、無かったりするんだと思われます。 https://doda.jp/guide/heikin/
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