無届け欠勤、無届け遅刻の概念について。

Question

無届け欠勤、無届け遅刻の概念について。お尋ね致します。
弊社に、体調不良で有給取得や遅刻（フレックス時差出勤）が日常的になっている管理職がいます。
メンタル不調からの復職者で、勤務時間が不安定なのは周囲も容認している面はあります。

一方で、有給取得申請やフレックス出勤申請が、決まって当日の昼前です。すなわち、連絡があるのは本人が起床した時点ということです。
病気がメンタル不調なので、本人から連絡があるまでみんな心配しますし、１０時過ぎて連絡がなかったら、会社から本人に電話することも多いです。

病気を容認しているとは言え、他の一般社員に示しがつかないです。

「管理職に労働時間概念なし」という話は置いといて、
有給取得や遅刻の申請は、法律や判例でみてどのタイミングから無断・無届けになるのでしょうか？
特に遅刻に関して朝起きた時点で申請してもOKというのは、あまりにも身勝手だと思います。

因みに弊社の始業時刻は朝９時です。
フレックスタイム制度はありますが、ルール上、前月に計画申請することになっています。これは形骸化していますが、みんな少なくとも前の週には所定のフォーマットで申請しています。

お詳しい方の見解をお願い致します。
一般職の場合、管理職の場合での違いも、わかればお聞かせください。

Answer 1

示しが付かないという理由なら、矯正（強制）させるか、切るかどちらかしか無いと思いますが、どちらが本音ですか？
中途半端な覚悟であれば放置するしか方法は有りません。

Answer 2

会社の上層部が容認している事なら、その上層部に対して「下の者に示しが付かない」と言うしかないのでは？
法がどうのこうのと言っても会社は容認しているなら、あとは社内で解決するしかないでしょ。