?派遣元が派遣社員に「>派遣先へ昇給のお礼を言うように・・・」っておかしくないですか?
派遣社員は派遣先に雇われているわけではないので、給料が上がったことに対してお礼を言う必要は無いですし、それを言わせる派遣会社が間違っています。
もし派遣先の上司にあたる方に礼を伝えるなら、
「派遣会社から伺いましたが、私のことを評価していただいたそうで、ありがとうございました。」って内容なら良いのではないでしょうか。
長く続けて行くつもりなら、「今後とも、よろしくお願いいたします。」って最後に付け加えれば良いのではないでしょうか。