①調査するお店が、だいぶ色んな場所にある様なんですが、そのまでの往復の交通費は、会社負担ですか?
大抵は謝礼に含まれています。
ただし、調査内容によっては結果的に赤字になることもあるみたいです。
②コピー商品を見つけたら、写メをして送る、と記載されていたのですが、お店で写メを撮る行為は、かなり怪しくないですか?
怪しいというより、恐らく禁止されているお店が多いのでは?
注意くらいで済むとは思いますが、仮に何かあっても自己責任になると思います。
③ノルマがあったり何か続かない理由など欠点はありますか?
ノルマは調査によると思います。