まず大学のレベルとしては、圧倒的に熊本大学が上になります。さらに学部を見ても、農学部よりも理学部の方が上になるのが普通です。 >研究者を目指すにはどちらの方が向いていると思いますか? 研究者を目指すならば、熊大でも佐賀大でもかまいませんが、その後、九州大などの旧帝大へ移籍が必要になると思います。大学院修士課程から旧帝大へ移り、そこで修士課程+博士課程の両方を修了すれば、運良く何かしら就職口が開けるかもしれません。
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イメージ面では熊本大学がだいぶ上です。 就職はそれほど変わらないかと。 研究者は本人次第なので、変わらないです。
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いまは経済状況が良いので、どちらでもそれなりに就職はできるでしょう。ただ、就職先に困らないのは農学部のほうだと思います(ただ中小企業が多いです)。理学部で院進+ドクターコースだと研究者コースですが、下手したらバイトよりも収入が低くなります。専攻や分野を良く選びましょう。
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