回答（3件）
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簡単にいうと、海上自衛隊は「海の軍隊」、海上保安庁は「海の警察」です。そのため、自衛隊の護衛艦はミサイルや艦砲などを装備しています。海上保安庁の巡視船は機関銃のみとなっています。仕事の違いは海上自衛隊は国を守ること（防衛）が主な任務で、海上保安庁は人を助けること（救助）、取り締まりが主な任務です。
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こちらを参考にしてください http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q1444969664
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