学卒より修士のほうが、研究室の教授のコネは使いやすいと思います。 5Sレベルでももし成績が学科トップクラスであれば、旧帝の成績の悪い人よりも真面目さや勤勉さは上との見方もでき、採用先がどのような人材を求めるかによって変わってくると思います。 すでに4年生とのことで学部成績は変えられないので修士課程で一生懸命頑張ることと、あとは院生の過去10年程度の就職先を良く調べて、自分の行きたい会社に複数人の採用実績がある研究室(→きっと先生のコネがついてます)を選ぶことが一番大事かと思います。
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旧帝大卒も大勢希望するような大手でも、それなりに全国区で万遍なく取ります。OBの実績を見て判断した方が良いです。
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