公務員の場合理系技術職だったとしても9割事務職なので全く問題ないと思います。 逆に理系の仕事したくて公務員の技術職になると、想像と違った、こんなに文書作ると思わなかった、とかになりやすいです。
転部は不可能です。あくまで理学部の募集に応募したわけですからね。 ただ、理学部だからって公務員の職が限定されるわけじゃありませんので、不安に思う必要は無いと思います。
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