研究者で国の研究機関で働いてる 研究者は公務員になるんですよね

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以前はその通りで、研究官として国家公務員研究職俸給表の適用を受ける国家公務員でした。国立研究所で採用されるためには、国家公務員上級職試験の物理や農学などに合格する必要がありました。電子技術総合研究所は通産省に、高エネルギー物理学研究所は文部科学省に、防災科学技術研究所は科学技術庁に、農業資源環境研究所は農林水産省に、国立環境研究所は環境省に、属していました。

現在は殆どの国立研究機関は、気象庁気象研究所などの一部を除いて、独立行政法人化されています。理化学研究所や国立環境研究所などの研究予算は国から出ていますが、組織としてはどの省庁にも属さず、研究者は公務員ではありません。公務員試験では無く、博士号取得者から公募による選考面接で採用者が決まります。