水産庁に配属されることはほぼないでしょう。 特に、お話しされているのが一般職の農政局採用のことであれば、農政局は林野庁・水産庁に関する業務を扱っていません。 総合職であれば、農林水産省の部署の中でも、 ・農林水産業に関する技術開発をどうするか ・農林水産業に関する環境対策をどうするか といったことを担当する、農・林・水横断的な仕事をする部署はありますから、そういったところに配属されれば、言わば間接的に水産に関することを扱うことになる可能性はあります。
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